Der Unterschied zwischen DNA- und RNA-Synthese

Sowohl die DNA- als auch die RNA-Synthese basieren auf der Festphasensynthesestrategie und der Phosphoramidit-Chemie. Ein DNA-Synthesizer könnte zur Synthese von RNA oder RNA-Analoga ohne weitere Modifikation verwendet werden, und die Reagenzien der DNA-Synthese könnten direkt in RNA und künstlichen Nukleinsäuren verwendet werden ' Synthese.Wie in Abbildung 1 dargestellt, ist die 2'-Hydroxygruppe im RNA-Phosphoramidit durch eine Silylschutzgruppe, z. B. t-Butyldimethylsilyl (TBDMS), geschützt, wodurch Nebenreaktionen an der fragilen 2'-Hydroxygruppe verhindert werden.Die sperrige TBDMS-Gruppe behinderte die Reaktion zwischen Phosphoramidit und der 5'-Hydroxygruppe auf dem festen Träger, und eine längere Kopplungszeit ist erforderlich, um die Kopplungseffizienz zu erreichen.

Ähnlich wie bei der DNA-Synthese wurde die synthetisierte RNA zunächst durch Aminolyse vom festen Träger abgespalten, dann wurde die TBDMS-Gruppe durch Tetrabutylammoniumfluorid (TBAF) oder Trimethylamintrihydrofluorid abgespalten.Rohe RNA konnte durch Umkristallisieren aus Alkohol und HPLC gereinigt werden.

DNA- und RNA-Synthese1

Abbildung 1. Die chemische Struktur der Grundbausteine ​​der DNA- und RNA-Synthese.

a) dABz-Phosphoramidit und b) rABz 2'-OTBDMS-Phosphoramidit.
Die Entwicklung von siRNA-Arzneimitteln erfordert die Strukturanaloga der nativen RNA, um die Biokompatibilität zu erhöhen. Die 2'-Hydroxygruppe auf der RNA könnte durch MeO, F und MOE-Gruppen ersetzt werden, und die fixierte Nukleinsäure (LNA) bietet auch eine gute Leistung in der RNA-Therapie (Figur 2).Diese Phosphoramidite ergeben bei der Synthese ähnliche Wirkstoffe wie DNA-Phosphoramidite, und der Aufarbeitungs- und Reinigungsprozess dieser nicht-natürlichen Nukleinsäuren ähnelt dem der nativen DNA.

DNA- und RNA-Synthese2

Abbildung 2. Die chemische Struktur der Bausteine ​​in siRNA-Medikamenten.a) dABz 2-MeO-Phosphoramidit;b) dABz 2-F Phosphoramidit;c) dABz 2-MOE-Phosphoramidit und d) dABz-gesperrtes Phosphoramidit.

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Zeitpunkt der Veröffentlichung: 09.08.2022